重慶市工商行政管理局萬州區分局設在三峽庫區腹心萬州區，是重慶市工商行政管理局的直屬機構，主管萬州區的市場監管和行政執法工作。全局現有干部職工367名，其中公務員319名、工勤人員31名、事業編制工作人員17名。內設機關科室15個、直屬機構1個、事業單位1個，下轄22個工商所。

分局在區委、區政府及重慶市工商局的領導下，弘揚“永不言苦、永不服輸、永爭一流”的萬州工商精神，圍繞“一切圍繞經濟，一切為了經濟，一切服務經濟”的指導思想,充分發揮工商職能，相繼出臺《關于進一步放寬市場主體準入，促進萬州經濟發展若干政策措施的實施意見》、《關于進一步支持非公經濟發展的實施意見》、《貫徹落實市委市政府關于加快萬州經濟社會發展決定的實施意見》等一系列文件，降低門檻，傾力服務萬州經濟，大力支持庫區產業發展。特別是2009年，及時出臺《關于應對金融危機充分發揮工商職能促進全區經濟平穩較快增長的實施意見》，積極幫助企業突圍脫困，為重慶城鄉統籌發展和萬州經濟持續快速增長作出了積極的貢獻。